MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. 41578 plasmid pSEEH1578_03

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021869	GCG	2	6	45	50	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021869	A	7	7	202	208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021869	A	6	6	267	272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021869	ACA	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021869	A	7	7	308	314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021869	TGT	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526222928
7	NC_021869	G	7	7	408	414	0 %	0 %	100 %	0 %	526222928
8	NC_021869	ACAG	2	8	436	443	50 %	0 %	25 %	25 %	526222928
9	NC_021869	ACG	2	6	569	574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222928
10	NC_021869	TGA	2	6	594	599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222928
11	NC_021869	T	6	6	687	692	0 %	100 %	0 %	0 %	526222928
12	NC_021869	AAC	2	6	713	718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526222928
13	NC_021869	TGGAA	2	10	719	728	40 %	20 %	40 %	0 %	526222928
14	NC_021869	GCAAC	2	10	845	854	40 %	0 %	20 %	40 %	526222928
15	NC_021869	TGA	2	6	895	900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222928
16	NC_021869	AAC	2	6	907	912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021869	AGC	2	6	918	923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021869	TCGCTG	2	12	1013	1024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
19	NC_021869	TCCAGC	2	12	1032	1043	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	526222929
20	NC_021869	TGC	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
21	NC_021869	GCC	2	6	1059	1064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
22	NC_021869	GCT	2	6	1119	1124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
23	NC_021869	CCTG	2	8	1140	1147	0 %	25 %	25 %	50 %	526222929
24	NC_021869	CGCT	2	8	1163	1170	0 %	25 %	25 %	50 %	526222929
25	NC_021869	AGT	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222929
26	NC_021869	CTG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
27	NC_021869	GCT	2	6	1269	1274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
28	NC_021869	ATC	2	6	1331	1336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222929
29	NC_021869	GCG	2	6	1387	1392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222929
30	NC_021869	CGC	2	6	1422	1427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
31	NC_021869	GAT	2	6	1471	1476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526222929
32	NC_021869	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
33	NC_021869	CCA	2	6	1507	1512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222929
34	NC_021869	CAG	2	6	1537	1542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
35	NC_021869	GGC	2	6	1648	1653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222929
36	NC_021869	TTCTC	2	10	1659	1668	0 %	60 %	0 %	40 %	526222929
37	NC_021869	CTG	3	9	1741	1749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526222929
38	NC_021869	C	6	6	1829	1834	0 %	0 %	0 %	100 %	526222929
39	NC_021869	ATGCTG	2	12	1848	1859	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526222929
40	NC_021869	CAC	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526222929
41	NC_021869	C	6	6	1931	1936	0 %	0 %	0 %	100 %	526222929
42	NC_021869	CCG	2	6	2024	2029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
43	NC_021869	GCCT	2	8	2134	2141	0 %	25 %	25 %	50 %	526222929
44	NC_021869	CAG	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
45	NC_021869	GCC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
46	NC_021869	AGGAC	2	10	2311	2320	40 %	0 %	40 %	20 %	526222929
47	NC_021869	T	6	6	2334	2339	0 %	100 %	0 %	0 %	526222929
48	NC_021869	CTT	2	6	2371	2376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526222929
49	NC_021869	CAG	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222929
50	NC_021869	ACCGG	2	10	2439	2448	20 %	0 %	40 %	40 %	526222929
51	NC_021869	CCG	2	6	2454	2459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222929
52	NC_021869	ATC	2	6	2484	2489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222929
53	NC_021869	GCG	2	6	2554	2559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222931
54	NC_021869	GCC	2	6	2586	2591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526222931
55	NC_021869	AGC	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222931
56	NC_021869	GCGG	2	8	2688	2695	0 %	0 %	75 %	25 %	526222931
57	NC_021869	CAG	2	6	2757	2762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222931
58	NC_021869	CGG	2	6	2764	2769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526222931
59	NC_021869	CGGG	2	8	2847	2854	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021869	CGG	2	6	2982	2987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021869	CCT	2	6	3078	3083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021869	GCG	2	6	3120	3125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021869	CAGGA	2	10	3173	3182	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021869	GCG	2	6	3190	3195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_021869	C	6	6	3219	3224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_021869	GTG	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021869	TGG	2	6	3305	3310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021869	C	7	7	3447	3453	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_021869	GA	3	6	3560	3565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021869	GGC	2	6	3587	3592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021869	TAAC	2	8	3677	3684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021869	A	6	6	3690	3695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021869	T	6	6	3712	3717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021869	ACG	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021869	TGA	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021869	CAG	2	6	3781	3786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021869	A	7	7	3866	3872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021869	TA	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021869	GTTG	2	8	3898	3905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021869	ATT	2	6	3930	3935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021869	TGC	2	6	4064	4069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021869	T	7	7	4111	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021869	ACCA	2	8	4128	4135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021869	GT	3	6	4157	4162	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021869	CGA	2	6	4239	4244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021869	AT	3	6	4293	4298	50 %	50 %	0 %	0 %	526222932
87	NC_021869	ACG	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222932
88	NC_021869	AAT	2	6	4314	4319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526222932
89	NC_021869	CAT	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526222932
90	NC_021869	AAG	2	6	4447	4452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526222932
91	NC_021869	CAG	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526222932
92	NC_021869	AATT	2	8	4484	4491	50 %	50 %	0 %	0 %	526222932
93	NC_021869	AG	3	6	4622	4627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021869	A	6	6	4651	4656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021869	ATT	2	6	4685	4690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021869	T	7	7	4689	4695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021869	AGC	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.